El Real de San Pedro de Boca de Leones surgió gracias al descubrimiento de un rico yacimiento de plata de baja ley en una de las puntas del cerro del mismo nombre en el año de 1690. Su mina principal se llamó San Francisco de Asís, de la que por su extensión y riqueza se separó una parte de ella, la cual se llamó y encomendó a Nuestra Señora de los Dolores.

Este expediente da cuenta de la visita de inspección que ordenó el Alcalde Mayor y minero con décadas de experiencia Juan de Lastres y Castillo. Al concluir las investigaciones, los veedores contratados informaron que la mina de la Señora de los Dolores estaba en terrible estado. Ante ello, se mandó a los parcioneros que se encargaran de arreglarla bajo la pena de que se les despojaría de la propiedad, pues de ella dependía la parte más importante del sustento del Real. Esto resultó fundamental para vislumbrar las faltas administrativas y presunta corrupción durante años en esta época y lugar.

Francisco Villafranca en el año de 1767 se unió a otros empresarios y hombres deseosos de invertir su caudal en la aventura de dar forma al Real de San Carlos del Vallecillo, una nueva población que de haber sido una hacienda se había convertido en un Real; es decir, un pueblo dedicado a la minería.

Este expediente es un testimonio de aquel acontecimiento, pues es uno de los primeros registros de una veta virgen en dicho lugar. La localización de la mina se dio al noroeste, en donde en los siguientes años se irían encontrando más y más yacimientos que le darían fama a la futura villa. Sus minerales consistieron en plata de baja ley y plomo, adecuados para el beneficio de metales por el método de fuego, una técnica poco especializada pero eficaz para este tipo de metales. El Alcalde Mayor, Juan Ángel de Ibarra, concedió sin dilación la licencia para que la veta fuera trabajada conforme a las ordenanzas y así impulsar la economía de la nueva región, el nuevo reino y de la Corona Española.

Joaquín Flores y Matías Garza, ambos del Real San Carlos de Vallecillo y operarios de Mina, piden que se les tome posesión de una mina vieja que fue trabajada durante muchos años por Don José Cordero Ruiz, encontrándose cerca de la hacienda de las señoras Plazas.

Estas dos personas pedían que la mina fuera nombrada Nuestra Señora del Refugio, sin embargo, las autoridades encontraron un problema; pues a principios de 1810 aquel nombre se le concedió al yacimiento trabajado por Don José Alejandro Ramón de Burgos y Don José de Jesús Rocha, por lo que se designó a un perito para que verificara la extensión de aquella mina.

Las autoridades citaron a José Alejandro y a Jesús Rocha, para saber si tenían inconvenientes en que el nombre de la mina denunciada por Joaquín Flores y Matías Garza fuese llamada Nuestra Señora del Refugio; tanto José Alejandro como Jesús Rocha no tuvieron reparos en ceder el nombre de su yacimiento.

Por lo tanto, aquel febrero de 1810 existieron dos minas llamadas Nuestra Señora del Refugio, pero con diferentes dimensiones.